財政部南區國稅局表示，醫療院所醫師的執行業務所得，是將各項應申報收入減除藥品、材料等成本及業務所產生各項必要費用後的餘額為所得額，其中所謂的收入，包含全民健康保險收入、部分負擔收入、掛號費收入及門診自費收入等。

官員表示，健保收入方面，由於國稅局與健保局系統有架接，皆可勾稽申報狀況，一般醫療院所鮮少會漏報；但像是自費收入等非健保收入，就會有醫療院所未如實申報，但國稅局透過課稅資料蒐集，仍然可發現端倪。

官員表示，自費收入雖不像健保收入一樣容易勾稽，但透過各種課稅資料的蒐集、比對，若發現顯著異常，國稅局都會進一步查核，呼籲醫療院所應如實申報。